На кафедрі є 4 навчальні аудиторії та 2 лабораторії. Вони повністю облаштовані для проведення занять зі студентами. У них проходить теоретична та практична підготовка студентів за загальними курсами для бакалаврів та магістрів, а також спеціалізована підготовка майбутніх ботаніків та екологів.
У нас зберігаються живі культури мікроводоростей, грибів та бактерій для проведення біохімічних та біотехнологічних досліджень.
На кафедрі ботаніки та екології рослин зберігається національне надбання України – гербарій Харківського національного університету імені В. Н. Каразіна (CWU). Гербарій CWU є цінною базою данних з фіторізноманіття України та Євразії. Ця колекція є важливою складовою для підготовки майбутніх біологів і, зокрема, ботаніків. Навчальний гербарій використовується на лекціях та практичних заняттях у якості демонстраційного матеріалу.
Також на кафедрі є власний музей, в якому зберігаються висушені та фіксовані препарати рослин, грибів, лишайників та водоростей. Частина експонатів також використовується при проведенні занять зі студентами. Окрім того, що колекція представлена чималою кількістю зразків, вона має ще історичну цінність. У музеї містяться експонати, зібрані різними вченими під час їх численних експедицій по різним куточкам не тільки України, а й світу.